Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HCC1Q9Y3T6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms