Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHL20Q9Y2M5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL20Q9Y2M5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms