Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX6Q9UNH7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX6Q9UNH7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms