Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPDR1Q9UM22 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms