Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC9Q9UKV0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC9Q9UKV0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms