Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL4Q9UJQ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL4Q9UJQ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms