Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC88CQ9P219 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms