Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCNT4Q9P109 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCNT4Q9P109 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms