Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COA4Q9NYJ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms