Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHBDL2Q9NX52 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms