Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM28Q9NW13 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM28Q9NW13 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms