Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZDHHC18Q9NUE0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZDHHC18Q9NUE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms