Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 STAU2-211ENST00000521293 552 ntTSL 45.65□□□□□ -1.512e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.552e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.582e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-209ENST00000520945 472 ntTSL 44.9□□□□□ -1.632e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-223ENST00000523160 227 ntTSL 34.66□□□□□ -1.662e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.912e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 537.68■■■■□ 3.627e-9■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 227.99■■■□□ 2.071e-7■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.855e-8■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 522.02■■□□□ 1.122e-22■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 532.16■■■□□ 2.744e-7■■■■□ 22.5
DROSHAQ9NRR4 PPP2R3B-209ENST00000484364 732 ntTSL 227.7■■■□□ 2.024e-6■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 PPP2R3B-207ENST00000477636 519 ntTSL 525.54■■□□□ 1.684e-6■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 421.69■■□□□ 1.065e-9■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.41e-11■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.441e-11■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.291e-11■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)21.89■■□□□ 1.11e-11■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.681e-11■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 RNH1-216ENST00000529368 727 ntTSL 232.42■■■□□ 2.785e-6■■■■□ 22.4
DROSHAQ9NRR4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.459e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.749e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 329.43■■■□□ 2.36e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.086e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.516e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.696e-7■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.522e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 22.3
DROSHAQ9NRR4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.082e-6■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-213ENST00000529739 842 ntTSL 226.76■■□□□ 1.873e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-221ENST00000592137 536 ntTSL 320.2■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-215ENST00000530560 558 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.393e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.23e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.063e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 TYK2-208ENST00000527481 628 ntTSL 314.51□□□□□ -0.093e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.62e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 PANX2-203ENST00000402472 2291 ntTSL 225.81■■□□□ 1.721e-6■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 335.25■■■■□ 3.235e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 235.25■■■■□ 3.235e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.25e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 534.49■■■■□ 3.115e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.15e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.975e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.485e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.485e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 329.79■■■□□ 2.365e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.255e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.175e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.945e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 526.98■■□□□ 1.915e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.85e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 226.32■■□□□ 1.85e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 326.32■■□□□ 1.85e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.785e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 525.88■■□□□ 1.735e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 325.8■■□□□ 1.725e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.575e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 323.78■■□□□ 1.45e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 523.16■■□□□ 1.35e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 222.63■■□□□ 1.215e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.115e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 221.1■□□□□ 0.975e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 321.03■□□□□ 0.965e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 521.03■□□□□ 0.965e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 321■□□□□ 0.955e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 519.77■□□□□ 0.765e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 314.88□□□□□ -0.035e-9■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 516.43■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 SCRIB-207ENST00000531942 421 ntTSL 234.29■■■■□ 3.089e-7■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-30■■■■□ 22.2
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.063e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.93e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)26.84■■□□□ 1.893e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 220.01■□□□□ 0.793e-8■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 536.17■■■■□ 3.387e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.397e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-208ENST00000507655 845 ntTSL 527.74■■■□□ 2.037e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 324.75■■□□□ 1.557e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-215ENST00000512098 566 ntTSL 521.48■■□□□ 1.037e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.637e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-219ENST00000515395 1398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.427e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.817e-7■■■■□ 22.1
DROSHAQ9NRR4 SSBP2-211ENST00000509013 709 ntTSL 59.69□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 22.1
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