Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD163L1Q9NR16 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD163L1Q9NR16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms