Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED4Q9NPJ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED4Q9NPJ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms