Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PRM3Q9NNZ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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