Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms