Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms