Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
C10orf88Q9H8K7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C10orf88Q9H8K7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms