Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRDE2Q9H7Z3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRDE2Q9H7Z3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms