Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC86Q9H6F5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms