Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms