Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MED28Q9H204 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED28Q9H204 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms