Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP44Q9H0E7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP44Q9H0E7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms