Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIF3L1Q9GZT8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms