Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPR88Q9GZN0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR88Q9GZN0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms