Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHACTR1Q9C0D0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHACTR1Q9C0D0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms