Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2OQ9C0C9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2OQ9C0C9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms