Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMES1Q9C002 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMES1Q9C002 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms