Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms