Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FUNDC2Q9BWH2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms