Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB2BQ9BVA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB2BQ9BVA1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms