Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTA3Q9BTC8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTA3Q9BTC8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms