Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms