Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GINS3Q9BRX5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms