Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC77Q9BR77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms