Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPOCK3Q9BQ16 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK3Q9BQ16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms