Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHP1Q99653 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms