Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POP1Q99575 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POP1Q99575 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POP1Q99575 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POP1Q99575 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POP1Q99575 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POP1Q99575 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POP1Q99575 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POP1Q99575 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POP1Q99575 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP1Q99575 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP1Q99575 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP1Q99575 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP1Q99575 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms