Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHOX2BQ99453 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHOX2BQ99453 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms