Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TCF12Q99081 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCF12Q99081 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms