Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YME1L1Q96TA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YME1L1Q96TA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms