Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARXQ96QS3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARXQ96QS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ARXQ96QS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARXQ96QS3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms