Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC38A2Q96QD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC38A2Q96QD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC38A2Q96QD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A2Q96QD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms