Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC6Q96NY7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC6Q96NY7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms