Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YPEL4Q96NS1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms