Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSNARE1Q96NA8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms