Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMTD1Q96MG8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms