Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC17Q96LX7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms