Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SAMD8Q96LT4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SAMD8Q96LT4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SAMD8Q96LT4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SAMD8Q96LT4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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